Eesti Ornitoloogiaühing on korraldanud Natura 2000 linnualade linnustiku seiret alates 2012. aastast. Seireid on läbi viidud ornitoloogiaühingu väljatöötatud seirekava ja metoodika alusel ning rahastatud Keskkonnainvesteeringute Keskuse (KIK) toetusel.

Eesti Ornitoloogiaühing kuulutas välja hanke "Natura linnualade seired 2025" (viitenumber 289518).

Eesti Ornitoloogiaühing esitas mai alguses halduskohtule kaebuse kormoranide munade õlitamise korralduste tühistamiseks ja taotluse õlitamise peatamiseks, sest jätkuvalt pole tõendatud munade õlitamise vajalikkust. Halduskohus jättis esialgse õiguskaitse taotluse rahuldamata.

Tallinna Halduskohus rahuldas Eesti Ornitoloogiaühingu kaebuse ja tunnistas Keskkonnaameti kevadised korraldused kormoranimunade õlitamiseks õigusvastaseks.

Eesti Ornitoloogiaühing vaidlustas halduskohtus valdavalt kaitsealade sihtkaitsevöönditesse antud load kormoranimunade õlitamiseks.

Eesti Ornitoloogiaühing kuulutas välja hanke "Natura 2000 linnualade linnustiku inventuurid 2023" (viitenumber 256601).

Eesti Ornitoloogiaühing kuulutas välja hanke "Natura 2000 linnualade linnustiku inventuurid 2022" (viitenumber 242227).

Tähelepanelik vaatleja märkas 17. jaanuaril, et Pakri saarte lähedal merel toimus nafta ümberpumpamine ühelt tankerilt teisele. Tegevuse tagajärjeks oleks võinud olla ulatuslik naftareostus rahvusvahelise tähtsusega Natura 2000 linnualal.

Eesti Ornitoloogiaühing kuulutas välja hanke "Muraka linnuala haudelinnustiku inventuur ja Meelva ning Meenikunno linnuala haudelinnustiku ja sookure rändekogumi inventuur 2021" (viitenumber 230214).

Eesti Ornitoloogiaühing kuulutas välja hanke "Natura 2000 linnualade linnustiku inventuurid 2021" (viitenumber 228582).